Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HKR1P10072 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HKR1P10072 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms