Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms