Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms