Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms