Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK1P06493 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK1P06493 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms