Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1AO95602 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1AO95602 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms