Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms