Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms