Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPHP4O75161 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPHP4O75161 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms