Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG13O75143 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG13O75143 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG13O75143 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms