Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNSO60931 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNSO60931 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNSO60931 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNSO60931 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNSO60931 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms