Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms