Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRTO14522 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRTO14522 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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