Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TTLL13PA6NNM8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TTLL13PA6NNM8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms