Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms