Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TPRKBQ9Y3C4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms