Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD4AQ9UPU9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms