Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1BQ9UPS6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms