Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMCC3Q9ULS5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms