Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIMS3Q9UJD0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms