Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA3Q9UI47 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms