Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRBP1Q9P2E9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms