Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEBOXQ9HB31 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms