Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms