Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM2Q9BVW6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM2Q9BVW6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM2Q9BVW6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM2Q9BVW6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM2Q9BVW6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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