Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EYA3Q99504 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms