Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD1Q99460 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD1Q99460 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms