Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHIPQ96QV1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms