Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB3A2Q96PL1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms