Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP3Q96P20 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP3Q96P20 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms