Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms