Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4CQ96DT6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms