Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATRIPQ8WXE1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms