Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.29
APCDD1LQ8NCL9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APCDD1LQ8NCL9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms