Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H1FOOQ8IZA3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms