Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SETXQ7Z333 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SETXQ7Z333 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms