Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTF1AQ7RTS3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms