Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD1Q6UXZ0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD1Q6UXZ0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms