Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 NUDCD3-205ENST00000472246 570 ntTSL 48.54□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 32.3
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PRPF8Q6P2Q9 DNMBP-204ENST00000636706 5437 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 ENY2-211ENST00000521688 2922 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.243e-16■■■■■ 32.2
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PRPF8Q6P2Q9 UCK1-206ENST00000482398 274 ntTSL 56.87□□□□□ -1.313e-16■■■■■ 32.2
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PRPF8Q6P2Q9 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.571e-7■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 TBC1D7-210ENST00000428109 832 ntTSL 35.15□□□□□ -1.581e-8■■■■■ 32.2
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PRPF8Q6P2Q9 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.643e-16■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 TBC1D7-207ENST00000420456 790 ntTSL 54.44□□□□□ -1.71e-8■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.735e-6■■■■■ 32.2
PRPF8Q6P2Q9 RNF115-201ENST00000539368 3097 ntTSL 1 (best)4.12□□□□□ -1.753e-16■■■■■ 32.2
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PRPF8Q6P2Q9 BMI1-208ENST00000602358 943 ntTSL 33.01□□□□□ -1.931e-6■■■■■ 32.2
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