Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCTP1Q6DN14 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms