Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP170Q5SW79 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP170Q5SW79 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms