Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms