Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms