Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ESCO2Q56NI9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms