Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms