Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IMPG1Q17R60 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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