Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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