Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZIC1Q15915 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZIC1Q15915 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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