Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
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