Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 HMGN1-213ENST00000482192 793 ntTSL 312.3□□□□□ -0.443e-25■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.453e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ARID1B-201ENST00000319584 2199 ntTSL 212.16□□□□□ -0.465e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-208ENST00000553545 591 ntTSL 411.91□□□□□ -0.55e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 BAZ2A-216ENST00000551996 849 ntTSL 511.87□□□□□ -0.515e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSD2-210ENST00000482415 3602 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.515e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HMGN1-215ENST00000485550 745 ntTSL 511.83□□□□□ -0.523e-25■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.525e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 AARS-203ENST00000565361 839 ntTSL 511.68□□□□□ -0.545e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRSF10-202ENST00000341154 2839 ntTSL 211.56□□□□□ -0.565e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TTF2-204ENST00000469638 775 ntTSL 211.48□□□□□ -0.575e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.585e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 AC046185.1-201ENST00000580553 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.585e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ARID1B-225ENST00000637532 445 ntTSL 511.02□□□□□ -0.655e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.655e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSD2-202ENST00000353275 7980 ntTSL 1 (best)10.99□□□□□ -0.655e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RBM10-203ENST00000377604 3747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.685e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 MGEA5-204ENST00000429860 769 ntTSL 310.8□□□□□ -0.682e-9■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRSF10-206ENST00000374453 866 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.695e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RPF2-203ENST00000441448 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.75e-18■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EIF3L-201ENST00000381683 1599 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.725e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 AARS-202ENST00000564359 590 ntTSL 310.54□□□□□ -0.725e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.745e-7■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 WARS-233ENST00000556660 584 ntTSL 410.37□□□□□ -0.755e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-235ENST00000556698 640 ntTSL 410.37□□□□□ -0.755e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-241ENST00000557347 577 ntTSL 410.37□□□□□ -0.755e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRSF10-203ENST00000343255 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.765e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SETD5-211ENST00000443339 3478 ntTSL 210.29□□□□□ -0.765e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSD2-201ENST00000312087 8050 ntTSL 1 (best)10.2□□□□□ -0.785e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRSF10-214ENST00000492112 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.785e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 FYTTD1-204ENST00000418169 593 ntTSL 59.95□□□□□ -0.823e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PRRC2A-205ENST00000464079 451 ntTSL 29.93□□□□□ -0.825e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRSF10-210ENST00000473858 778 ntTSL 29.78□□□□□ -0.845e-7■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.874e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HNRNPH3-205ENST00000469172 3356 ntTSL 29.58□□□□□ -0.884e-13■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.925e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-211ENST00000553808 1060 ntTSL 29.28□□□□□ -0.925e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HMGN1-201ENST00000288344 1303 ntTSL 29.27□□□□□ -0.933e-25■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRPK1-205ENST00000423325 4357 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.953e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 YARS-205ENST00000472692 773 ntTSL 59.06□□□□□ -0.965e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SETD5-201ENST00000302463 4786 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.975e-7■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 EIF3L-211ENST00000476955 583 ntTSL 58.71□□□□□ -1.025e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRSF10-204ENST00000344989 3487 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.025e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ARID1B-218ENST00000636748 8853 ntTSL 28.62□□□□□ -1.035e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.044e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SRSF10-207ENST00000453840 1808 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.055e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HNRNPH3-203ENST00000461310 648 ntTSL 58.47□□□□□ -1.054e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 FYTTD1-203ENST00000415708 1342 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.063e-8■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.15e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.115e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PRDX1-205ENST00000447184 606 ntTSL 58.1□□□□□ -1.113e-8■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.171e-10■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.185e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DARS-205ENST00000449218 543 ntTSL 37.6□□□□□ -1.195e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EIF2AK1-208ENST00000474029 609 ntTSL 37.55□□□□□ -1.25e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.215e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.225e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ARID1B-231ENST00000637887 1468 ntTSL 57.39□□□□□ -1.235e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HNRNPH3-209ENST00000486854 635 ntTSL 27.31□□□□□ -1.244e-13■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-227ENST00000556295 517 ntTSL 37.29□□□□□ -1.245e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EIF3L-206ENST00000439997 787 ntTSL 57.19□□□□□ -1.265e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-237ENST00000557094 582 ntTSL 27.04□□□□□ -1.285e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EIF3L-212ENST00000477256 1708 ntTSL 57.03□□□□□ -1.285e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EIF2AK1-210ENST00000495565 629 ntTSL 36.99□□□□□ -1.295e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.295e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.98□□□□□ -1.292e-9■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 UTP6-207ENST00000579878 582 ntTSL 26.9□□□□□ -1.35e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 BHLHE40-202ENST00000460806 396 ntTSL 26.89□□□□□ -1.315e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ARID1B-206ENST00000452544 4443 ntTSL 26.87□□□□□ -1.315e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SETD5-202ENST00000399686 3362 ntTSL 56.87□□□□□ -1.315e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.313e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SETD5-206ENST00000413704 3428 ntTSL 26.84□□□□□ -1.315e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PDCD6IP-216ENST00000495235 428 ntTSL 26.84□□□□□ -1.315e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-240ENST00000557297 821 ntTSL 36.67□□□□□ -1.345e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SETD5-228ENST00000493918 4861 ntTSL 1 (best)6.67□□□□□ -1.345e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.353e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 IPO5-213ENST00000479736 668 ntTSL 26.58□□□□□ -1.365e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PDCD6IP-208ENST00000465122 894 ntTSL 36.56□□□□□ -1.365e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DARS-207ENST00000463008 412 ntTSL 56.51□□□□□ -1.375e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TOMM7-206ENST00000496129 520 ntTSL 1 (best)6.51□□□□□ -1.375e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 IPO5-226ENST00000493492 474 ntTSL 36.5□□□□□ -1.375e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TAX1BP1-208ENST00000457186 1174 ntTSL 56.37□□□□□ -1.395e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 WARS-213ENST00000554084 866 ntTSL 56.32□□□□□ -1.45e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.43e-8■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 EIF3L-204ENST00000414316 581 ntTSL 56.25□□□□□ -1.415e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.413e-8■□□□□ 8.5
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